Там не может быть трибунала - это не армия, это наемники. К ней даже не смогли применить штрафные санкции за отказ выполнять свою работу, потому что бомбежка мирного населения не прописана в контракте - она же прямо говорит: "Ну нафиг, я на это не подписывалась".
В принципе, очевидно, что происходящее - либо произвол сумасшедшего полковника, либо выполнение им чьих-то указаний, неофициальных, идущих мимо Сэлфриджа, а возможно, вообще мимо корпорации. Его цель - развязать войну и устроить геноцид и он всеми силами этого добивается.
Кстати, возможно, проштрафившаяся Труди не оказалась взаперти вместе со всеми потому, что полковнику нужен был этот побег. Очень удобно - мешающие его планам ученые становятся ему врагами, их можно зачистить вместе с синими обезьянами. Тогда понятно и почему стрелять выбежал сам - у охраны могло не хватить духу стрелять по своим, не было приказа, пока сориентировались бы, потеряли время.